地理标志（原产地名称）与原产地证明商标的不同之处：
(1)以商标保护形式认为：
TRIPS协议强调知识产权私权地位，而地理标志属于知识产权范畴，地理标志(原产地名称)是一种表明商品来源的标记，在法律属性上属于知识产权范畴，是一种私权，通过商标制度保护地理标志完全符合TRIPS协议的要求。我国商标法所定义的地理标志与TRIPS协议的定义基本一致，都是包含原产地的特征的特殊的地理标志，应当适用《商标法》进行保护；
地理标志和商标的基本功能相同，均为区别商品来源的商业标记，商标类别中的证明商标除了标示来源之外，还有表示商品质量的作用，与地理标志尤其是原产地名称的作用完全相同，故而可以接纳为证明商标的一种形式；
从证明商标的定义上看，在我国地理标志(原产地名称)属于证明商标的范畴。对原产地证明商标进行注册保护，可以有效地提高产品在国内、国际市场上的知名度和竞争力。
通过证明商标形式保护地理标志(原产地名称)使现有商标法律制度充分发挥作用，无须投入过多的资源，比建立一个新的制度容易得多；
地理标志(原产地名称)只有在国内注册证明商标后，才可以依据我国加入的国际条约(《商标国际注册马德里协定》和《马德里协定有关议定书》)，去实现国际注册，并且可以充分利用有关优先权的规定，及早获得国际注册，有利于商标注册人在国内、国际贸易中运用法律武器保护自身权益。按照国际惯例，在原产地名称与商标权发生冲突时，必须执行“申请在先”原则，所以，我国现在运用较成熟的商标注册、管理体系来对原产地证明商标进行保护，既可以发挥现有体系和人员优势，可以节省单独设立专管部门的物质和人力资源，又可以充分利用完备的注册商标档案体系，避免原产地证明商标和已注册在先商标权的冲突。
(2)而以质量保护形式认为：
原产地名称和商标的属性截然不同，原产地域标志是一个地域的名称，属于这个地域共有，而不能由某个特定企业或个人独占。而商标是私权，可由个人或单个企业所有。以商标形式保护原产地域标志无法解决产权归属问题。
地理标志是一特殊种类的商业标志，和商标的区别就在于并不是由其所属的某个经营者独家享有专用权，而是由某一地区内经营者的代表机构进行注册和管理，凡是该地域内的经营者都可以使用；
地理标志具有惟一性，不得转让和买卖，在时间上具有永久性。而商标则可以自由转让，权利保护也是有时间限制的。故此商标法的保护无法保证地理标志的惟一性和永久性。
地理标志不仅仅是一个简单的识别标志，同时也是一种质量标准，而商标法在管理制度和方法上无法保证产品的质量和信誉。对原产地名称的保护一方面是对标识的保护，但更重要的是对质量的监督和生产过程的控制。
